Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox5P52651 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox5P52651 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.6 ms