Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp1P52624 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp1P52624 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp1P52624 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp1P52624 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp1P52624 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp1P52624 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp1P52624 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp1P52624 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp1P52624 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms