Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ApodP51910 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ApodP51910 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ApodP51910 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ApodP51910 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ApodP51910 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ApodP51910 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ApodP51910 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ApodP51910 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ApodP51910 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ApodP51910 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ApodP51910 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ApodP51910 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ApodP51910 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ApodP51910 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ApodP51910 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ApodP51910 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ApodP51910 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ApodP51910 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ApodP51910 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ApodP51910 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ApodP51910 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ApodP51910 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ApodP51910 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ApodP51910 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ApodP51910 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ApodP51910 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ApodP51910 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ApodP51910 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ApodP51910 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ApodP51910 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ApodP51910 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ApodP51910 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ApodP51910 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ApodP51910 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ApodP51910 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ApodP51910 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ApodP51910 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ApodP51910 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ApodP51910 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ApodP51910 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ApodP51910 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ApodP51910 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ApodP51910 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ApodP51910 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ApodP51910 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ApodP51910 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ApodP51910 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ApodP51910 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ApodP51910 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ApodP51910 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ApodP51910 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ApodP51910 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ApodP51910 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ApodP51910 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ApodP51910 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ApodP51910 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ApodP51910 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ApodP51910 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ApodP51910 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ApodP51910 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ApodP51910 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ApodP51910 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ApodP51910 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApodP51910 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApodP51910 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApodP51910 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApodP51910 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApodP51910 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApodP51910 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApodP51910 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ApodP51910 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApodP51910 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApodP51910 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApodP51910 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApodP51910 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApodP51910 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApodP51910 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms