Protein–RNA interactions for Protein: P51410

Rpl9, 60S ribosomal protein L9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9P51410 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl9P51410 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl9P51410 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms