Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pa2g4P50580 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pa2g4P50580 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms