Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx3P50481 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx3P50481 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms