Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms