Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcntP48725 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcntP48725 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcntP48725 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcntP48725 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcntP48725 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcntP48725 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcntP48725 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PcntP48725 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcntP48725 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcntP48725 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcntP48725 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcntP48725 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcntP48725 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcntP48725 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcntP48725 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcntP48725 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcntP48725 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcntP48725 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcntP48725 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PcntP48725 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcntP48725 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcntP48725 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcntP48725 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PcntP48725 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcntP48725 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcntP48725 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcntP48725 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PcntP48725 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcntP48725 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcntP48725 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcntP48725 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcntP48725 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcntP48725 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcntP48725 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcntP48725 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcntP48725 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcntP48725 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcntP48725 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcntP48725 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PcntP48725 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcntP48725 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcntP48725 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcntP48725 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcntP48725 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcntP48725 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcntP48725 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcntP48725 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcntP48725 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcntP48725 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcntP48725 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcntP48725 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcntP48725 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcntP48725 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcntP48725 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcntP48725 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcntP48725 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcntP48725 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcntP48725 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcntP48725 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcntP48725 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcntP48725 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcntP48725 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcntP48725 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcntP48725 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcntP48725 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcntP48725 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcntP48725 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcntP48725 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PcntP48725 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcntP48725 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcntP48725 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcntP48725 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcntP48725 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcntP48725 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcntP48725 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcntP48725 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcntP48725 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms