Protein–RNA interactions for Protein: P43252

Ptgir, Prostacyclin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgirP43252 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtgirP43252 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtgirP43252 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PtgirP43252 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgirP43252 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgirP43252 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgirP43252 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgirP43252 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgirP43252 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgirP43252 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtgirP43252 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtgirP43252 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtgirP43252 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms