Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec3bP43025 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms