Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Syt4P40749 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syt4P40749 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syt4P40749 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syt4P40749 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt4P40749 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt4P40749 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt4P40749 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt4P40749 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms