Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox7P40646 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox7P40646 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox7P40646 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms