Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TfamP40630 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TfamP40630 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TfamP40630 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TfamP40630 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TfamP40630 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TfamP40630 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TfamP40630 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TfamP40630 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TfamP40630 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TfamP40630 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TfamP40630 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TfamP40630 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TfamP40630 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TfamP40630 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TfamP40630 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TfamP40630 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TfamP40630 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TfamP40630 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TfamP40630 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TfamP40630 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TfamP40630 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TfamP40630 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TfamP40630 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TfamP40630 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TfamP40630 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TfamP40630 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TfamP40630 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TfamP40630 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TfamP40630 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TfamP40630 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TfamP40630 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TfamP40630 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TfamP40630 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TfamP40630 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TfamP40630 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TfamP40630 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TfamP40630 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TfamP40630 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TfamP40630 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TfamP40630 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TfamP40630 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TfamP40630 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TfamP40630 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TfamP40630 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TfamP40630 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TfamP40630 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TfamP40630 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TfamP40630 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TfamP40630 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TfamP40630 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TfamP40630 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TfamP40630 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TfamP40630 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TfamP40630 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TfamP40630 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TfamP40630 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TfamP40630 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TfamP40630 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TfamP40630 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TfamP40630 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TfamP40630 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TfamP40630 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TfamP40630 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TfamP40630 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TfamP40630 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TfamP40630 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TfamP40630 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TfamP40630 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TfamP40630 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TfamP40630 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TfamP40630 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TfamP40630 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TfamP40630 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TfamP40630 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TfamP40630 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TfamP40630 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TfamP40630 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TfamP40630 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TfamP40630 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TfamP40630 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TfamP40630 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TfamP40630 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TfamP40630 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TfamP40630 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TfamP40630 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TfamP40630 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TfamP40630 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TfamP40630 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TfamP40630 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TfamP40630 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TfamP40630 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TfamP40630 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TfamP40630 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TfamP40630 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TfamP40630 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TfamP40630 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TfamP40630 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TfamP40630 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TfamP40630 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms