Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fen1P39749 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fen1P39749 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fen1P39749 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fen1P39749 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fen1P39749 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fen1P39749 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fen1P39749 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fen1P39749 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fen1P39749 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fen1P39749 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fen1P39749 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fen1P39749 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fen1P39749 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fen1P39749 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fen1P39749 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fen1P39749 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fen1P39749 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms