Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lig1P37913 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lig1P37913 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lig1P37913 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lig1P37913 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lig1P37913 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lig1P37913 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lig1P37913 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lig1P37913 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms