Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprkP35822 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprkP35822 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprkP35822 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprkP35822 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprkP35822 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprkP35822 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprkP35822 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprkP35822 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprkP35822 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprkP35822 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprkP35822 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprkP35822 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms