Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms