Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Grin2aP35436 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Grin2aP35436 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Grin2aP35436 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Grin2aP35436 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Grin2aP35436 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Grin2aP35436 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Grin2aP35436 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Grin2aP35436 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Grin2aP35436 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Grin2aP35436 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Grin2aP35436 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Grin2aP35436 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Grin2aP35436 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms