Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab23P35288 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rab23P35288 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab23P35288 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab23P35288 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab23P35288 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab23P35288 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab23P35288 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab23P35288 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab23P35288 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms