Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms