Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms