Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd28P31041 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd28P31041 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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