Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tacr1P30548 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms