Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msr1P30204 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Msr1P30204 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msr1P30204 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msr1P30204 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms