Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprmP28828 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprmP28828 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprmP28828 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprmP28828 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprmP28828 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprmP28828 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprmP28828 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprmP28828 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprmP28828 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprmP28828 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprmP28828 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprmP28828 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprmP28828 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprmP28828 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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