Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Celf1P28659 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Celf1P28659 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Celf1P28659 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Celf1P28659 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Celf1P28659 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Celf1P28659 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Celf1P28659 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Celf1P28659 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Celf1P28659 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Celf1P28659 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Celf1P28659 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Celf1P28659 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Celf1P28659 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Celf1P28659 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Celf1P28659 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Celf1P28659 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Celf1P28659 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Celf1P28659 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Celf1P28659 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Celf1P28659 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Celf1P28659 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Celf1P28659 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Celf1P28659 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Celf1P28659 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Celf1P28659 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Celf1P28659 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Celf1P28659 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Celf1P28659 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Celf1P28659 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Celf1P28659 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Celf1P28659 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Celf1P28659 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Celf1P28659 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Celf1P28659 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Celf1P28659 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Celf1P28659 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Celf1P28659 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Celf1P28659 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Celf1P28659 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Celf1P28659 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Celf1P28659 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Celf1P28659 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Celf1P28659 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf1P28659 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf1P28659 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf1P28659 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf1P28659 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf1P28659 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf1P28659 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf1P28659 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf1P28659 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf1P28659 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf1P28659 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Celf1P28659 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Celf1P28659 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf1P28659 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Celf1P28659 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Celf1P28659 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf1P28659 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf1P28659 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf1P28659 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Celf1P28659 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Celf1P28659 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Celf1P28659 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Celf1P28659 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Celf1P28659 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Celf1P28659 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Celf1P28659 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Celf1P28659 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Celf1P28659 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Celf1P28659 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Celf1P28659 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Celf1P28659 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Celf1P28659 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Celf1P28659 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Celf1P28659 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Celf1P28659 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Celf1P28659 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Celf1P28659 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Celf1P28659 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Celf1P28659 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Celf1P28659 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms