Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav1P27870 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav1P27870 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav1P27870 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav1P27870 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vav1P27870 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vav1P27870 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vav1P27870 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms