Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2afxP27661 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2afxP27661 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2afxP27661 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2afxP27661 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2afxP27661 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2afxP27661 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
H2afxP27661 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms