Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CftrP26361 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CftrP26361 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CftrP26361 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CftrP26361 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CftrP26361 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CftrP26361 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CftrP26361 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CftrP26361 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CftrP26361 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CftrP26361 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CftrP26361 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CftrP26361 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CftrP26361 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CftrP26361 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CftrP26361 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CftrP26361 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CftrP26361 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CftrP26361 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CftrP26361 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CftrP26361 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CftrP26361 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CftrP26361 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CftrP26361 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CftrP26361 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CftrP26361 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CftrP26361 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CftrP26361 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CftrP26361 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CftrP26361 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CftrP26361 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CftrP26361 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CftrP26361 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CftrP26361 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CftrP26361 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CftrP26361 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CftrP26361 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CftrP26361 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CftrP26361 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CftrP26361 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CftrP26361 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CftrP26361 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CftrP26361 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CftrP26361 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CftrP26361 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CftrP26361 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CftrP26361 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CftrP26361 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CftrP26361 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CftrP26361 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CftrP26361 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CftrP26361 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CftrP26361 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CftrP26361 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CftrP26361 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CftrP26361 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CftrP26361 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CftrP26361 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CftrP26361 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CftrP26361 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CftrP26361 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CftrP26361 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CftrP26361 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CftrP26361 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CftrP26361 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CftrP26361 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CftrP26361 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CftrP26361 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CftrP26361 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CftrP26361 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CftrP26361 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CftrP26361 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CftrP26361 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CftrP26361 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CftrP26361 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CftrP26361 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CftrP26361 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CftrP26361 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CftrP26361 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CftrP26361 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CftrP26361 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CftrP26361 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CftrP26361 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CftrP26361 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CftrP26361 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CftrP26361 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CftrP26361 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CftrP26361 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CftrP26361 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CftrP26361 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CftrP26361 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CftrP26361 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CftrP26361 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CftrP26361 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CftrP26361 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CftrP26361 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CftrP26361 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CftrP26361 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CftrP26361 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CftrP26361 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms