Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdk11bP24788 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms