Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkchP23298 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkchP23298 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkchP23298 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkchP23298 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms