Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prim1P20664 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prim1P20664 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prim1P20664 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prim1P20664 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prim1P20664 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prim1P20664 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prim1P20664 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prim1P20664 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prim1P20664 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prim1P20664 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prim1P20664 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prim1P20664 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prim1P20664 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms