Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifrd1P19182 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms