Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpraP18052 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpraP18052 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpraP18052 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpraP18052 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpraP18052 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpraP18052 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpraP18052 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpraP18052 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpraP18052 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpraP18052 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms