Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Defa-rs1P17533 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Defa-rs1P17533 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Defa-rs1P17533 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Defa-rs1P17533 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Defa-rs1P17533 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Defa-rs1P17533 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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