Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms