Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl1P12850 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms