Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms