Protein–RNA interactions for Protein: P11881

Itpr1, Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itpr1P11881 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itpr1P11881 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr1P11881 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr1P11881 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr1P11881 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr1P11881 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr1P11881 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr1P11881 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr1P11881 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr1P11881 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms