Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FlgP11088 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FlgP11088 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FlgP11088 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FlgP11088 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FlgP11088 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FlgP11088 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FlgP11088 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FlgP11088 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FlgP11088 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FlgP11088 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FlgP11088 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FlgP11088 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FlgP11088 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FlgP11088 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FlgP11088 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FlgP11088 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FlgP11088 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FlgP11088 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FlgP11088 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FlgP11088 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FlgP11088 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FlgP11088 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FlgP11088 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FlgP11088 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FlgP11088 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FlgP11088 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FlgP11088 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FlgP11088 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FlgP11088 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FlgP11088 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FlgP11088 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FlgP11088 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FlgP11088 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FlgP11088 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FlgP11088 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FlgP11088 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FlgP11088 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FlgP11088 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FlgP11088 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FlgP11088 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FlgP11088 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FlgP11088 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FlgP11088 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FlgP11088 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FlgP11088 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FlgP11088 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FlgP11088 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FlgP11088 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FlgP11088 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FlgP11088 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FlgP11088 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FlgP11088 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FlgP11088 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FlgP11088 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FlgP11088 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FlgP11088 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FlgP11088 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FlgP11088 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FlgP11088 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FlgP11088 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FlgP11088 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FlgP11088 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FlgP11088 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FlgP11088 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FlgP11088 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FlgP11088 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FlgP11088 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FlgP11088 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FlgP11088 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FlgP11088 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FlgP11088 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FlgP11088 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FlgP11088 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FlgP11088 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FlgP11088 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FlgP11088 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FlgP11088 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FlgP11088 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FlgP11088 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FlgP11088 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FlgP11088 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FlgP11088 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FlgP11088 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FlgP11088 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FlgP11088 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FlgP11088 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FlgP11088 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FlgP11088 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FlgP11088 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FlgP11088 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FlgP11088 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FlgP11088 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
FlgP11088 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
FlgP11088 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FlgP11088 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FlgP11088 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FlgP11088 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FlgP11088 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FlgP11088 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms