Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spta1P08032 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms