Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms