Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01648 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01648 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01648 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01648 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01648 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01648 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01648 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01648 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01648 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01648 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01648 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
P01648 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01648 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01648 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01648 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01648 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01648 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01648 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01648 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01648 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01648 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01648 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01648 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01648 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01648 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01648 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
P01648 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
P01648 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
P01648 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01648 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01648 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01648 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01648 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01648 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01648 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01648 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
P01648 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01648 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01648 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01648 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01648 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01648 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01648 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01648 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01648 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01648 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01648 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01648 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
P01648 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01648 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01648 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01648 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01648 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01648 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01648 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01648 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01648 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01648 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01648 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01648 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01648 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01648 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01648 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01648 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01648 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01648 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01648 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01648 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01648 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01648 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01648 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01648 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01648 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01648 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01648 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01648 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
P01648 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01648 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01648 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01648 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01648 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01648 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01648 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01648 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01648 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01648 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01648 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01648 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01648 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01648 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01648 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01648 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01648 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01648 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
P01648 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01648 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01648 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01648 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01648 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms