Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms