Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd160O88875 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd160O88875 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd160O88875 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd160O88875 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd160O88875 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd160O88875 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd160O88875 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd160O88875 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd160O88875 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd160O88875 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd160O88875 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd160O88875 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms