Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tom1O88746 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tom1O88746 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tom1O88746 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tom1O88746 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tom1O88746 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tom1O88746 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tom1O88746 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tom1O88746 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tom1O88746 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tom1O88746 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tom1O88746 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms