Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme6O88425 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme6O88425 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme6O88425 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme6O88425 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme6O88425 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme6O88425 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme6O88425 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms