Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms