Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51dO55230 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms