Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms